Зміст
Швидкість мутації - це ймовірність опущення або зміни нуклеотиду в ДНК, спричинена або природними помилками в обробці ДНК (спонтанна мутація), або зовнішніми агентами (індукована мутація). Цю швидкість не слід плутати з частотою мутації, тобто кількістю випадків мутації в даному поколінні. Швидкість мутації для певного виду, як правило, екстраполюється з даних, порівнюючи всі послідовності ДНК у поперечному перерізі видів з даними їх нащадків. У лабораторії це зазвичай роблять, виділяючи зразок видів і дозволяючи їм розмножуватися протягом декількох поколінь.
Розрахунок швидкості видової мутації
Крок 1
Щоб полегшити процес, візьміть групу зразків видів гермафродітів (які запліднюють самі яйця і не потребують партнерів), які швидко розмножуються і для яких ви можете відтворити умови життя в лабораторії. Caenorhabditis Elegans - це невеликий вид аскарид, який відповідає цим критеріям і раніше був протестований на рівень його мутації.
Крок 2
Послідовно запишіть ДНК вашого виду.
Крок 3
Виділіть якомога більше особин різних видів, щоб ви могли управляти, утримувати і спостерігати протягом тривалого періоду часу в умовах, за яких, як відомо, істота процвітає. Це мінімізує ефект природного відбору, зменшуючи ваш генетичний зразок.
Крок 4
Для кожного покоління видів тримайте лише одне потомство.
Крок 5
Дозвольте якомога більшій кількості поколінь виникнути і померти, зазначаючи, скільки саме поколінь пройшло для кожного роду.
Крок 6
Візьміть випадкову або повну пробу ДНК у остаточного потомства і порівняйте її з послідовністю вихідного виду. Підрахуйте кількість змін.
Крок 7
Наприкінці експерименту використовуйте таке рівняння для розрахунку швидкості мутації для вашого виду: µ = m / (L x g x b)
де: µ = швидкість мутації m = кількість спостережуваних мутацій L = кількість експериментальних штамів g = середня кількість поколінь b = кількість секвенсованих пар основ