Зміст
Пептиди - це фрагменти коротких полімерів, що складаються з амінокислот. Кожен пептид має певну послідовність амінокислот, позначену трибуквенним кодом або лише одним; наприклад, амінокислота аланін скорочено називається "Ala" або "A". Навантаження пептидів у розчині залежить від його кислотності. Ізоелектрична точка (pI) відноситься до значення кислотності розчину, в якому молекула пептиду має чистий заряд, рівний нулю. Розчинність пептиду мінімальна в ізоелектричній точці. Використовуйте доступні веб-сервери для розрахунку значення pI для амінокислотної послідовності пептиду.
Крок 1
Розподіліть пептид за допомогою однобуквеного коду. Наприклад, якщо пептид має амінокислотну послідовність Ala-Ser-Glu-Leu-Pro (аланін - серин - глутамінова кислота - лейцин - пролін), тоді однобуквенна послідовність буде "ASELP". Якщо потрібно, зверніться до таблиці перетворення з одного букви в три літери, наданої в розділі Ресурси.
Крок 2
Використовуйте будь-який браузер, наприклад Internet Explorer або Firefox, для входу на сервер, який обчислює ізоелектричну точку пептиду (pI); див. Ресурси.
Крок 3
Введіть однобуквену послідовність пептиду - у нашому прикладі "ASELP" - у поле та натисніть "Обчислити".
Крок 4
Зчитайте значення ізоелектричної точки (pI), подане в рядку "Теоретичний pI / Mw" (теоретичний pl). У нашому прикладі pI дорівнює 4,00. Зверніть увагу, що сервер також обчислює молекулярну масу (Mw) пептиду.